Основной деятельностью Отделения являются фундаментальные исследования по выполнению государственных научно-технических программ Республики Башкортостан:

• "Инновационные технологии, используемые при проведении геологоразведочных работ, добыче, переработке полезных ископаемых в РБ";
• "Рациональное использование природных ресурсов и модернизация нефтегазовых технологий".

После Указа Президента Республики Башкортостан М.Г. Рахимова о создании Академии наук Республики Башкортостан (февраль 1991 г.) начинается формирование структурных подразделений Академии.

В числе первых в октябре 1991 г. были образованы:

• Отделение наук о Земле (академик-секретарь М.А. Камалетдинов, с 2005 г. – чл.-корр. АН РБ Ю.В. Казанцев);
• Отделение физико-математических и технических наук (академик-секретарь А.В. Бакиев)

Академия наук Республики Башкортостан  при своем создании объединила в свои ряды ученых, работающих в высших учебных заведениях, научно-исследовательских институтах и в системе академической науки.

Накопленные знания и огромный научный потенциал в вузах, опыт освоения передовых технологий в отраслевых институтах и фундаментальные исследования в академических учреждениях явились надежной основой создания самостоятельного Отделения нефти и газа в республиканской академии (июнь 1995 г.).

Первым академиком-секретарем был избран чл.-корр. АН РБ Н.Ф. Кагарманов. В 1997–2000 гг. Отделение возглавляли чл.-корр. АН РБ А.Ф. Ахметов, с 2000 г. – академик АН РБ А.В. Бакиев.

Отделение наук о Земле и природных ресурсов АН РБ образовалось путем укрупнения двух Отделений: наук о Земле и нефти и газа (сентябрь 2006 г.). Академиком-секретарем Отделения был избран академик АН РБ А.В. Бакиев.

В состав Отделения входят: Институт нефтегазовых технологий и новых материалов, Институт проблем транспорта энергоресурсов, Институт нефтехимпереработки.

В решении научных проблем нефтегазового дела активное участие принимают ученые Уфимского государственного нефтяного технического университета и Башкирского государственного университета.

В соответствии с научной специализацией ученые объединены в следующие научные советы:

• Общая и теоретическая геология;
• Геология нефти и газа;
• Геофизика и гидрогеология;
• Экология и природопользование;
• Проблемы нефтегазодобычи;
• Проблемы нефтегазопереработки;
• Транспорт нефти и газа;
• Нефтегазовое оборудование и аппаратостроение;
• Геоинформационные системы

Члены Отделения и исполнители ГНТП "Инновационные технологии, используемые при проведении геолого-разведочных работ, добыче, переработке полезных ископаемых в Республике Башкортостан" приняли участие в следующих симпозиумах и конференциях:

• VIII Конгресс нефтегазопромышленников России, г. Уфа, 20-23 мая 2008 г.;
• Х Международная научно-практическая конференция "Компьютерные науки и информационные технологии" Турция, Анталия;
  
• Международная научно-техническая конференция "Китайско-российское научно-техническое сотрудничество. Наука-образование-инновации", 15-23 июня 2008 г., Харбин;
  
• Международная научно-техническая конференция "Основные проблемы освоения и обустройства нефтегазовых месторождений и пути их решения", Оренбург, 26-27 июня 2008 г.;
  
• II Международный экологический форум "Окружающая среда и здоровье человека", г. Санкт-Петербург;
  
• Х IV международная специализированная выставка "Энергетика Урала-2008" и VI Международная специализированная выставка "Энергосбережение -2008" 23 октября 2008 г., Уфа;
  
• V Всеросиийская научно-практическая конференция "Организация тер-ритории", 2008, Уфа;
  
• VII Межрегиональная конференция "Геология, полезные ископаемые и проблемы геоэкологии Башкортостана, Урала и сопредельных территорий", г. Уфа.;
  
• Международная молодежная школа-семинар "Рудоносность ультрамафит-мафитовых и карбонатитовых комплексов складчатых областей", г. Улан-Уде;
  
• IV Сибирская международная конференция молодых ученых по наукам о Земле, г. Новосибирск;
  
• Х IV Научная студенческая школа "Металлогения древних и современных океанов – 2008. Рудоносные комплексы и рудные фации", г. Миасс;
  
• Международная научно-техническая конференция "Химические реактивы, реагенты и процессы малотоннажной химии", Уфа;
  
• Международная научно-практическая конференция "Нефтегазопереработка и нефтехимия", Уфа;
  
• Х Международная конференция "Тепловое поле Земли и методы его изучения", 17-17 июня 2008 г., г. Москва;
  
• Конференция "Новая техника и технологии для геофизических исследований скважин", 21 мая 2008 г., г. Уфа.

"Геология. Известия Отделения наук о Земле и природных ресурсов" (издается с 1997 г.).

• Научный совет «Геофизика и гидрогеология»
• Научный совет «Общая и теоретическая геология»
• Научный совет «Геология нефти и газа»
• Научный совет «Геофинформационные системы»
• Научный совет «Экология и природопользование»
• Научный совет «Проблемы нефтегазодобычи»
• Научный совет «Проблемы нефтехимпереработки»
• Научный совет «Транспорт нефти и газа»
• Научный совет «Нефтегазовое оборудование и аппаратостроение»

• ГАНУ «Институт нефтегазовых технологий и новых материалов»
• Центр гидравлики трубопроводного транспорта
• Центр энергосбережения РБ