Уфимский НИИ гигиены и профзаболеваний создан в соответствии с распоряжением Совета министров РСФСР №3241–Р от 8 сентября 1955 г. и приказом Министра здравоохранения РСФСР за №503 от 14 декабря 1955 г.; приказом Министра здравоохранения РСФСР №113-а от 16.12.92 г. переименован в «Уфимский научно-исследовательский институт медицины труда и экологии человека» Министерства здравоохранения Российской Федерации.

Распоряжением правительства РФ от 17.01.2005 г. №32-Р институт переименован в Федеральное государственное учреждение науки «Уфимский научно-исследовательский институт медицины труда и экологии человека» Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека.

Институт является некоммерческой государственной организацией, финансируемой за счет средств бюджета на основе сметы. Основной профиль института: медицина труда, экология человека, гигиена окружающей среды, охрана здоровья промышленных рабочих и населения в регионе с преимущественным развитием нефтяной, нефтеперерабатывающей, нефтехимической и химической промышленности; анализ и оценка профессиональных и экологических техногенных рисков и разработка системы управления рисками.

Институт имеет клинику профессиональных заболеваний на 160 коек и поликлинику на 200 посещений в смену. С 1997 года институт является Сотрудничающим центром ВОЗ по медицине труда, в 2007 году срок полномочий института продлен ВОЗ до 20.07.2011 года.

В соответствии с лицензией № 156204 на право осуществления образовательной деятельности, выданной 5 апреля 2004 года Федеральной службой по надзору в сфере образования и науки, в институте организована аспирантура по специальности 14.00.07 – гигиена (медицинские и биологические науки) и клиническая ординатура по специальности профпатология.

Срок обучения в очной аспирантуре – 3 года, в заочной – 4 года. К конкурсу допускаются лица, имеющие законченное высшее образование по медицинским, биологическим, химическим или иным специальностям, связанным с деятельностью в области медицины труда, гигиены и экологии человека. Для поступающих в заочную аспирантуру трудовая деятельность должна быть связана с возможностью выполнения научных исследований по указанным направлениям.

Поступающие сдают вступительные экзамены по философии, иностранному языку и гигиене. На конкурс представляются следующие документы: заявление, личный листок по учету кадров, нотариально заверенная копия диплома о высшем образовании, характеристика с места работы, список научных работ (при отсутствии научных работ – реферат по актуальным проблемам гигиены), 2 фотографии размером 3х4 см.

Уфимский НИИ медицины труда и экологии человека проводит круглогодичный прием врачей в клиническую ординатуру по специальности профпатология. Обучение проводится по коммерческой форме (по контракту и на договорных условиях). Срок обучения – 2 года.

Поступающие сдают вступительные экзамены по специальности «профпатология». Поступающие представляют следующие документы: заявление, личный листок по учету кадров, нотариально заверенная копия диплома о высшем образовании, характеристика с места работы, 2 фотографии размером 3х4 см.