Карпухин И.Е. родился 5 февраля 1936 года в п. Васильевка Альшеевского района БАССР. Окончил Стерлитамакский педагогический институт (1960).

В 1960–1962 – учитель Стерлибашевской средней школы № 2, с 1962 г. – преподаватель Стерлитамакского пединститута, с 1967 г. – в Стерлитамакском государственном педагогическом институте: заместитель декана, декан факультета русского языка и литературы, с 1982 г. проректор по научной работе, с 2003 г. заведующий кафедрой.

Научные исследования И.Е. Карпухина посвящены изучению русского фольклора в многоэтничной среде Республики Башкортостан и его взаимодействия с фольклором других народов республики.

Автор более 500 научных, учебно-методических и творческих работ, включая 20 книг и брошюр; под его редакцией издано около 70 монографий, учебных пособий, сборников научных трудов и творческих работ.

Среди наиболее известных трудов ученого «Русская свадьба в Башкортостане (состояние, поэтика, межэтнические взаимосвязи)» (Уфа–Стерлитамак, 1999), «Частушки (в устах нерусских Башкортостана) » (Уфа, 2003), «Русское устное народное поэтическое творчество» (Стерлитамак, 2003),  «Частушки (устами русских)» (Уфа, 2006), «Сказки» (Уфа, 2008), «Свадьбы в Башкортостане на стыке тысячелетий» (Уфа, 2009).

С 1966 по 2014 гг. И.Е. Карпухиным организовано 11 фольклорных экспедиций, собран фольклорно-этнографический материал, записанный в 40 районах РБ.

Президиум Академии наук РБ и Отделение социально-гуманитарных наук и технологий АН РБ глубоко скорбят по поводу кончины Карпухина Ивана Егоровича и выражают соболезнования родным и близким.