М.Ф. Маликов окончил Казанский государственный университет, работал народным судьей в Республике Башкортостан, заведующим кафедрой государственного права юридического факультета (ныне Института права) БашГУ, конституционного права Стерлитамакского юридического факультета, теории и истории государства и права и конституционного права Башкирского института социальных технологий, деканом Стерлитамакского юридического факультета, директором Стерлитамакского филиала БашГУ, Ветеран труда, подготовил кандидатов и докторов юридических наук по специальностям 12.00.01, 12.00.02, 12.00.09, был членом четырех диссертационных советов вузов: Уфы (Юридический факультет БашГУ, кафедра теории познания и онтологии БашГУ), Казани (АН РТ), Челябинска (ЮрГУ).

В настоящее время — профессор кафедры предварительного расследования Уфимского юридического института МВД России, одновременно является: соучредителем и ученым секретарем Общественной организации Регионального отделения «Академии информатизации образования Республики Башкортостан», руководителем отдела исследования проблем конституционного и муниципального права Евразийского научно-исследовательского института проблем права, членом Отделения социально-экономических наук Академии наук Республики Башкортостан, академик Национальной Академии Общественного признания заслуг и достижений граждан, Международной академии наук высшей школы и Академии информатизации образования Российской Федерации, членом редколлегии журнала «Приволжский научный вестник»  и "Вестник БИСТ", членом Башкортостанского отделения общественной организации «Ассоциации юристов России», независимым экспертом по проведению антикоррупционной экспертизы проектов федеральных и региональных нормативных правовых актов, был руководителем комплексного исследования по Гранту АН РБ «Механизм согласования федерального и регионального законодательства» в 2008-2010 годах и Международному Гранту «Модернизация конституционного законодательства Республики Башкортостан в условиях трансформации федеративных отношений» на 2011-2013 годы.

Имеется сайт ученого-юриста Маликова М.Ф. (www.mmalikov.ru), где представлены научные труды. Сайтом пользуются ученые из стран: Россия, Украина, Соединенные Штаты Америки, Германия, Канада, Китай, Италия, Франция, Норвегия, Польша, Словакия, Нидерланды, Пакистан, Индия, Израиль, Армения, Киргизия, Марокко, Нигерия, Казахстан, Узбекистан, Беларусь, Таджикистан, Молдавия и др.

• История становления государственно-правовых учреждений Башкирии (1917-1924 гг.)./ Учебное пособие. – Уфа: БГУ, 1989. – 84 с.
• Проблемы реализации суверенитета Республики Башкортостан. Очерки. Документы. Нормативные акты. Хроника. Материалы к изучению курсов «Конституционное право Республики Башкортостан», «История государства и права Республики Башкортостан», «История Башкортостана». В 3-х томах. Автор-составитель. – Уфа: БашГУ, 1999.
• Теоретические основы государственной власти и самоуправления (автор-составитель). Сборник научных трудов в 8-ми томах / Автор-составитель. – Стерлитамак, 2000.
• Учебно-методический комплекс конституционного права Российской Федерации. В 2-х частях. - Уфа: БашГУ, 2000.
• Маликов М.Ф.  Региональное право: Учебное пособие. В 3-х томах. Т. 1. Теоретические и методологические основы / Изд-е  Башкирск. ун-та, 2002. –  380с.
• Маликов М.Ф.  Региональное право: Учебное пособие. В 5-ти томах.  Т. 2. Признаки и принципы регионального права. Уфа:  Изд-е  Башкирск. ун-та, 2002. –  376с.
• Маликов М.Ф.  Региональное право: Учебное пособие. В 5-ти томах.  Т. 3. Пути совершенствования регионального законодательства. – Уфа:  Изд-е  Башкирск. ун-та, 2002. –  306 с.
• Маликов М.Ф.  Региональное право: Учебное пособие. В 5-ти томах.  Т. 4. Региональное управление и правотворчество. – Уфа:  Изд-е  Башкирск. ун-та, 2002. –  320с.
• Маликов М.Ф.  Региональное право: Учебное пособие. В 5-ти томах.  Т. 5. Реализация регионального права. – Уфа:  Изд-е  Башкирск. ун-та, 2002. –  258с.
• Фаткуллин Ф.Н., Фаткуллин Ф.Ф., Маликов М.Ф. Теоретические основы реализации права: Монография. – Уфа: РИО БашГУ, 2003. – 244 с.
• Маликов М.Ф.  Основы конституционного права Российской Федерации: Учебное пособие. – Уфа: РИО БашГУ, 2003. – 240 с. 
  
• Правовые основы российского федерализма (автор-составитель).- Уфа: РИО БашГУ, 2004. - 778 с.
• Маликов М.Ф. Система науки конституционного права: Организационно-методическое пособие. – Уфа: РИО БашГУ, 2005. – 377 с.
• Методология изучения реализации государственной молодежной политики Республики Башкортостан. Монография. - Уфа: БашГУ, 2007. - 160 с.
• Современные проблемы конституционного права Российской Федерации: курс лекций / М.Ф, Маликов. - 2-е изд., испр.  и доп. - Уфа: ДизайнПресс, 2011. - 321 с.
• Механизм согласования  федерального и регионального законодательства. Комплексное научно-правовое исследование. В 5-частях. Ч. 1: Методология изучения механизма согласования федерального и регионального законодательства / М.Ф, Маликов. - Уфа: Гилем, 2008. -136 с.
• Механизм согласования федерального и регионального законодательства. Часть 2. Совершенствование государственности Республики Башкортостан: Учебно-практическое пособие. – Маликов М.Ф. -Уфа:БашГУ, 2009. – 340 с.
• Механизм согласования федерального и регионального законодательства. Часть 3. Современные проблемы конституционного права Республики Башкортостан. Монография. – Уфа: Китап, 2009. – 396 с.
• Маликов М.Ф., Минеев Е.М. Механизм согласования федерального и регионального законодательства. Комплексное научно-правовое исследование. Часть 4. Двухуровневое правовое регулирование в Российской Федерации: конституционно-правовые основы.  Монография. - Уфа: «Гилем» 2010. – 215с.
• Механизм согласования федерального и регионального законодательства. Комплексное научно-правовое исследование. Часть 5: Конституционное законодательство Республики Башкортостан. Выводы и предложения по результатам мониторинга / М.Ф. Маликов. - Уфа: АН РБ, Гилем, 2011. - 136 с.
• Истоки познания. Том. 1: Социально-политические очерки. Издание второе, дополненное и переработанное. Изд. 2-е, доп. и перераб. -  Уфа: Гилем АН РБ, 2012. - 288 с.
• Истоки познания. Том 2: Концепция государственной власти и самоуправления в современной России. Изд. 3-е, испр.  и доп. / М.Ф. Маликов. -  Уфа: АН РБ, Гилем, 2012. - 378 с.
• Истоки познания. Том 3: Гносеологические основы реализации права. Изд. 4-е, перераб.  и доп. / М.Ф, Маликов. -  Уфа: АН РБ, Гилем, 2012. - 240 с.
• Истоки познания. Т. 4: Генетические основы регионального права: по материалам Республики Башкортостан. Изд. 8-е, перераб.  и доп. / М.Ф. Маликов. - Уфа: АН РБ, Гилем, 2012. - 460 с.  
  

Полный список публикаций см. http://mmalikov.ru/index.php/publik.html

Признанный вклад в теорию правоотношений М.Ф. Маликова заключается в разработанных им концепциях:

• всеобщего равновесия и компромисса в происхождении и развитии государства и права;
• императивно-репрессивного характера правопонимания и правоприменения в союзном законодательстве;
• несогласованности цели в современном федеральном (региональном) законодательстве с процессуальными средствами его реализации;
• самостоятельной ценности социально-экономических и политико-идеологических факторов в разработке и принятии законодательства и его реализации;
• согласованного суверенитета в децентрализации власти и субординационных началах федерального и регионального законодательства;
• одновременной реализации материальных и процессуальных норм права в механизме правового регулирования;
• оптимизации федерального и регионального законодательства в предметах совместного ведения федерации и её субъектов;
• организационно-правовых форм восполнения пробелов в региональном законодательстве с учетом экономических особенностей регионов;
• формирование гражданского общества на основе стандартов демократии мирового сообщества;
• развитие самоуправленческих начал в российской государственности посредством конституционных методов осуществления народовластия (народного суверенитета);
• современной регионализации экономических особенностей субъектов федерации в рамках «согласованного суверенитета», «согласованного разделения полномочий», «разделения суверенитета государства».