Научный совет занимается планированием и координацией научных исследований по аграрной экономике. Исследования научного совета направлены на выполнение Государственных научно-технических программ.

Научный совет проводит обсуждение рабочих программ, хода выполнения и результатов научных исследований, организует научно-практические конференции и семинары по актуальным проблемам аграрной экономики, оказывает содействие аспирантам и соискателям в проведении научных исследований, готовит предложения для государственных и сельскохозяйственных органов по развитию агропродовольственного сектора экономики.

По итогам исследований, проводимых в рамках научно-технических программ, получены следующие наиболее значимые результаты:

• разработана научно-обоснованная система ведения агропромышленного производства в Республике Башкортостан;
  
• установлена возможность удвоения валового внутреннего продукта в аграрной сфере Республики Башкортостан путем оптимизации производства продукции растениеводства и используемых ресурсов;
  
• обоснованы пути развития крестьянских (фермерских) хозяйств и их кооперации с сельскохозяйственными предприятиями;
  
• разработана методика сравнительной экономической оценки эффективности производства продукции растениеводства и на этой основе подготовлены рекомендации по оптимизации структуры посевных площадей зерновых, зернобобовых, крупяных и кормовых культур для типовых хозяйств и районов Республики Башкортостан;
  
• обоснованы меры по созданию экономических условий для повышения эффективности функционирования сельскохозяйственных организаций;
  
• разработана методика оплаты труда работников сельскохозяйственных организаций в условиях рыночной экономики и др.