Научные направления: наука о растительности, луговедение, агроэкология, охрана биологического разнообразия на уровне сообществ, экологическое образование.
Создал ряд сводок по теории науки о растительности; разработал и внедрил дериват метода классификации растительности по Браун-Бланке; разработал концепцию и программу экологической оптимизации структуры агроэкосистем; опубликовал серию учебников для вузов, учебников и учебных пособий для средней школы по ботанике, науке о растительности и экологии.
Создал уфимскую научную школу фитоценологов. Среди его учеников 15 докторов и 56 кандидатов наук.
Автор более 1000 научных трудов, в т.ч. более 50 монографий, учебников и учебных пособий. Награжден орденом Салавата Юлаева (2007), медалью "Найрамдал" (МНР, 1975).