Предметом деятельности Института является:

• создание сортов и гибридов плодово-ягодных культур, пользующихся спросом на рынке;
• разработка и внедрение научно-обоснованных технологий производства высококачественной продукции плодово-ягодных культур;
• другие виды лицензированной деятельности по согласованию с Академией наук РБ.

Целью деятельности Института является проведение фундаментальных научных исследований в области растениеводства, создание сортов и гибридов плодово-ягодных культур, разработка рекомендаций по организации, технологии производства высококачественной продукции. Предмет деятельности – создание сортов плодово-ягодных культур, пользующихся спросом на рынке, разработка и внедрение научно обоснованных технологий производства высококачественной продукции.

За последние 80 лет в Институте:

• выведено 25 сортов яблони, 3 – груши, 23 – смородины черной, 3 – смородины золотистой, 2 – земляники, 11 – винограда. В настоящее время в Государственный реестр селекционных достижений включено 17 сортов плодово-ягодных культур селекции Башкирского НИИСХ;
  
• разработаны и внедрены в производство технологии возделывания плодово-ягодных культур, включающие в себя оптимальную схему посадки яблони, вишни, смородины, малины для лесостепной и северовосточной зоны садоводства республики; нормы внесения минеральных удобрений при посадке; систему формирования кроны яблони, режимы орошения.

Научно-исследовательская работа выполняется по трем темам:

• "Создание зимостойких, высокопродуктивных сортов груши, смородины золотистой, винограда с высокими технологическими качествами плодов и ягод";
  
• "Определение в условиях РБ жизнеспособность малораспространенных культур (жимолость, калина, рябина красная, шиповник, актинидия, айва японская и др.)";
  
• "Усовершенствование отдельных элементов технологии плодовых культур (способы выращивания саженцев из зимних прививок и зеленых черенков на основе использования физиологически активных веществ и биопрепаратов)".

В 2008 году получены следующие научные результаты:

• переданы и проходят государственное сортоиспытание в соседних областях два сорта груши Башкирская летняя и Башкирская осенняя.
  
• выделено 2 элитных и 3 перспективных гибрида груши, 4 перспективных гибрида золотистой смородины, 6 перспективных сеянцев винограда.
  
• выращено саженцев сортов селекции института (тыс. шт.): груши - 0,9, смородины - 0,5 и винограда - 6,5.

В результате сравнительной оценки малораспространенных культур выделены сорта:

• жимолости - Длинноплодная, Галочка, Берель, Черничка, Бакчарская;
  
• калины -Киевская сладкая, Красная гроздь;
  
• шиповника - Уральский чемпион, Тихон;
  
• актинидии - Сентябрьская, ВИР-2, Ароматная, Цилиндрическая.

Высокие показатели продуктивности в маточнике и выхода саженцев яблони при зимней прививке отмечены y среднерослых подвоев ММ- 106, 71-3-150, 6-4-1, 6-9-14, и у слаборослых - 62-396, 54-1 18.

Государственное автономное научное учреждение Институт аграрных исследований создано на базе Центра селекции сельскохозяйственных культур АН РБ путем реорганизации (Постановление Правительства РБ № 133 от 7.04.2009г.).

Центр селекции сельскохозяйственных культур АН РБ был создан в 2004 году в соответствии с Приказом Академии наук РБ №28 от 20 октября 2004 года о создании Центра селекции сельскохозяйственных культур АН РБ.