Ильяс Иштуганович родился 25 января 1949 года в деревне Таишево Мечетлинского района БАССР. Окончил Гурьевский государственный педагогический институт Казахской ССР (1973). В 1992 г. защитил диссертацию на соискание ученой степени кандидата педагогических наук по теме «Самоуправление учащихся как средство эффективности патриотического воспитания (на материалах национальных школ-интернатов Башкирской АССР)», в 1999 г. – диссертацию на соискание ученой степени доктора педагогических наук по теме «Этнопедагогические основы патриотического воспитания школьников (на материале Республики Башкортостан)».

1973–1975 гг. – ответственный секретарь Макатского районного общества «Знание»; 1975–1978 гг. – заведующий кабинетом политпросвещения Макатского райкома партии Гурьевской области Казахской ССР; 1979–1982 гг. – директор средней школы № 5 г. Уфы; 1982–1984 гг. – инструктор отдела науки и учебных заведений Башкирского обкома КПСС; 1984–1991 гг. – директор школы-интерната № 1 г. Уфы; 1991–2000 гг. – директор средней школы № 124 г. Уфы; 2001–2005 гг. – проректор по довузовской подготовке и переподготовке научно-педагогических кадров, директор лицея Башкирского государственного аграрного университета; 2005–2010 – первый заведующий кафедрой педагогики и психологии Уфимской государственной академии экономики и сервиса (УГАЭС); 2010–2015 гг. – профессор Башкирского государственного аграрного университета; с 2015 года – директор АНО «Научно-исследовательский Центр мустаеведения».

В 2011-2015 гг. являлся членом Научного совета Академии наук РБ по педагогике и психологии.

Член редколлегии журнала «Учитель Башкортостана».

Избирался депутатом Уфимского горсовета народных депутатов (1990-1995 гг.).

Действительный член Академии педагогических и социальных наук (1995), академик  Международной педагогической академии (1996), член-корреспондент Российской академии естествознания  (2009), член Союза писателей России (2009), член Союза писателей Республики Башкортостан (2016), член Союза писателей-переводчиков РФ (2009), член союзов журналистов РБ и РФ (1993).

Отличник народного образования РСФСР (1986), Отличник просвещения СССР (1988), Почетный работник общего образования РФ (2003), Почетный  работник высшего профессионального образования РФ (2011), заслуженный деятель науки и образования РАЕ (2010).

Народный учитель Республики Башкортостан (2023). 

Награжден орденом Салавата Юлаева (2022), почетным знаком ГДР «За заслуги в народном образовании», Почетной грамотой Министерства просвещения Башкирской АССР (1981), Почетной грамотой ЦК ВЛКСМ (1986), Почетной грамотой Министерства науки и высшего образования РФ (2022), Почетной грамотой Академии наук РБ (2024).

Удостоен Международной премии им. академика Г.Н. Волкова, премии Союза писателей РБ им. Степана Злобина, награжден медалями К.Д. Ушинского (2002), В.И. Вернадского (2009), Мустая Карима (2009), М.М. Джалиля (2006), Т.С. Мальцева (2008), В.А. Сухомлинского (2009), М.А. Шолохова (2021), золотой медалью Европейской научно-промышленной Палаты. Объявлена Благодарность Министерства просвещения СССР (1982). Лауреат республиканского телевизионного конкурса «Лидеры региона - 2020».

О жизни, научно-педагогической деятельности и творчестве И.И. Валеева изданы книги «Воспитание историей» (Уфа, 1991), «Ильяс Валеев: штрихи к портрету» (Уфа, 2009), «Ильяс Валеев: материалы к биографии» (Уфа, 2002); БСТ сняты документальные фильмы «Инсан. Ильяс Валеев», «Преодоление» (в семи частях); имеются статьи в энциклопедиях: «Мечетлинский район» (2000), «Башкирская энциклопедия» (т. II, 2006), «Ученые России» (т. V, 2009).

Автор более 500 научных и учебно-методических работ, среди которых:

«Народность и патриотизм» (Уфа, 2000);

«Башкирская этнопедагогическая культура и Мустай Карим» (Уфа, 2002);

«Воспитание на символах» (Уфа, 2004);

«Традиции башкирского национального воспитания в творчестве Мустая Карима» (Уфа, 2005);

«Общество и инновационная школа» (М., 2005);

«Российская деревня в XX столетии» (Уфа, 2006);

«Духовная власть земли» (Уфа, 2007),

«Мустай Карим – явление мировой культуры». В 2 т. (Уфа, 2007),

«Нравственные уроки Мустая Карима» (Уфа, 2008)

«Мустам Карим о религии» (М., 2009);

«Башкирская этнопедагогическая культура как фактор мировой цивилизации». В 3-х т. (Уфа, 2012);

«Гуманизм Мустая Карима». В 2 т. (Уфа, 2013);

«Советский период истории России» (Уфа, 2014);

«Постсоветская Россия» (Уфа, 2015);

«Средняя и высшая школы современной России» (Уфа, 2017);

«Мустай Карим и его эпоха» (Уфа, 2019);

«Проблемы патриотизма в России: горький опыт 90-х» (Уфа, 2023);

«Историческая педагогика» (Уфа, 2024).

Монография И.И. Валеева «Мустай Карим: воин, поэт, гражданин» была презентована 3 сентября 2004 года на XVII Московской Международной выставке-ярмарке.

И.И. Валеев более 40 лет посвятил педагогическому труду, разработал приоритетную для современной России научную проблему воспитания молодежи на традициях народной педагогики и патриотического воспитания учащихся, а также впервые в стране всесторонне изучил творческое наследие Мустая Карима, его жизненный путь, обосновав вывод о том, что он является достоянием мировой культуры. Ильяс Иштуганович – один из инициаторов открытия памятника Салавату Юлаеву в городе Палдиски Эстонской ССР; музеев Мустая Карима, Рами Гарипова, Рашита Нигмати, истории гимназии-интерната №1 им. Р. Гарипова; учреждения памятной медали «Мустай Карим», премии имени Рами Гарипова.

Впервые в стране им внедрена лента выпускников в уфимской школе № 5 (1980). Под руководством Валеева И.И. в школе-интернате № 1 впервые в стране начато совмещение выпускных экзаменов в школе и вступительных в вузы (с 1987 г. в Уфимский авиационный и Башкирский медицинский институты), впервые в СССР начато углубленное профильное изучение математики с 7 класса и открыта заочная республиканская математическая школа для учащихся 4–8 классов. Впервые в республике внедрена зачетная система для учащихся, одобренная Министерством просвещения РСФСР, начато изучение информатики с применением ЭВМ и создана школьная телестудия и школьный ученический завод «Светэл».

В рамках Академии наук РБ им выполнены научные проекты: «Мустай Карим в поликультурном мире» (грант РГНФ, 2007-2008), «Мустай Карим - явление мировой культуры» (тема ГНТП РБ, 2006), «Великие и знаменитые: парадоксы детства» (2005), «Российская деревня в XX столетии» (2006), «Народный поэт из Кугарчи» (2007), «Педагогические миниатюры Мустая Карима» (2009) (проекты ФФИ АН РБ ), «Башкирская этнопедагогическая культура как фактор мировой цивилизации» (грант РГНФ, 2009-2010). 

Под руководством И.И. Валеева защищены 3 кандидата наук по специальности «педагогика».